MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 50453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015555	ACC	2	6	238	243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333895863
2	NC_015555	A	6	6	327	332	100 %	0 %	0 %	0 %	333895863
3	NC_015555	ATA	2	6	334	339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895863
4	NC_015555	GCA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895863
5	NC_015555	A	7	7	391	397	100 %	0 %	0 %	0 %	333895863
6	NC_015555	GAA	3	9	424	432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
7	NC_015555	TGT	2	6	525	530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895863
8	NC_015555	CGC	2	6	555	560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333895863
9	NC_015555	TA	3	6	609	614	50 %	50 %	0 %	0 %	333895863
10	NC_015555	ATGC	2	8	646	653	25 %	25 %	25 %	25 %	333895863
11	NC_015555	GAC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895863
12	NC_015555	GAA	2	6	760	765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
13	NC_015555	AATA	2	8	772	779	75 %	25 %	0 %	0 %	333895863
14	NC_015555	GAC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895863
15	NC_015555	A	6	6	826	831	100 %	0 %	0 %	0 %	333895863
16	NC_015555	AGG	2	6	842	847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333895863
17	NC_015555	ATA	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895863
18	NC_015555	CCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333895863
19	NC_015555	CCA	2	6	988	993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333895863
20	NC_015555	A	6	6	1024	1029	100 %	0 %	0 %	0 %	333895863
21	NC_015555	A	6	6	1082	1087	100 %	0 %	0 %	0 %	333895863
22	NC_015555	TAA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895863
23	NC_015555	ATA	2	6	1198	1203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895863
24	NC_015555	CAAA	2	8	1205	1212	75 %	0 %	0 %	25 %	333895863
25	NC_015555	AAG	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
26	NC_015555	TAC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895863
27	NC_015555	A	6	6	1290	1295	100 %	0 %	0 %	0 %	333895863
28	NC_015555	GAA	2	6	1381	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
29	NC_015555	GAA	2	6	1474	1479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
30	NC_015555	ATT	2	6	1759	1764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895864
31	NC_015555	TAAA	2	8	1773	1780	75 %	25 %	0 %	0 %	333895864
32	NC_015555	C	6	6	1797	1802	0 %	0 %	0 %	100 %	333895864
33	NC_015555	ACC	2	6	1805	1810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333895864
34	NC_015555	ACA	2	6	1848	1853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895864
35	NC_015555	TAC	2	6	1867	1872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895864
36	NC_015555	GTA	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
37	NC_015555	GTT	2	6	1934	1939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895864
38	NC_015555	GAT	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
39	NC_015555	T	8	8	1989	1996	0 %	100 %	0 %	0 %	333895864
40	NC_015555	TGA	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
41	NC_015555	TA	4	8	2019	2026	50 %	50 %	0 %	0 %	333895864
42	NC_015555	TTC	2	6	2062	2067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895864
43	NC_015555	TGA	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
44	NC_015555	TAA	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895864
45	NC_015555	AGA	2	6	2124	2129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895864
46	NC_015555	A	7	7	2266	2272	100 %	0 %	0 %	0 %	333895864
47	NC_015555	AGA	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895864
48	NC_015555	A	6	6	2296	2301	100 %	0 %	0 %	0 %	333895864
49	NC_015555	GAT	2	6	2306	2311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
50	NC_015555	TAC	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895864
51	NC_015555	TGA	3	9	2371	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
52	NC_015555	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
53	NC_015555	TAGA	2	8	2541	2548	50 %	25 %	25 %	0 %	333895864
54	NC_015555	TTG	2	6	2555	2560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895864
55	NC_015555	ATC	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895864
56	NC_015555	A	7	7	2738	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	333895864
57	NC_015555	ATA	2	6	2780	2785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895864
58	NC_015555	AGA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895864
59	NC_015555	TGA	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
60	NC_015555	ATG	2	6	2861	2866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895865
61	NC_015555	TGG	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895865
62	NC_015555	A	6	6	3011	3016	100 %	0 %	0 %	0 %	333895865
63	NC_015555	A	7	7	3048	3054	100 %	0 %	0 %	0 %	333895865
64	NC_015555	TAAA	2	8	3064	3071	75 %	25 %	0 %	0 %	333895865
65	NC_015555	TTG	2	6	3125	3130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895866
66	NC_015555	CTG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895866
67	NC_015555	TTA	2	6	3238	3243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895866
68	NC_015555	GTTT	2	8	3286	3293	0 %	75 %	25 %	0 %	333895866
69	NC_015555	ATT	3	9	3302	3310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895866
70	NC_015555	GAA	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895866
71	NC_015555	T	6	6	3385	3390	0 %	100 %	0 %	0 %	333895866
72	NC_015555	TACT	2	8	3440	3447	25 %	50 %	0 %	25 %	333895866
73	NC_015555	T	6	6	3452	3457	0 %	100 %	0 %	0 %	333895866
74	NC_015555	AAG	2	6	3498	3503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895866
75	NC_015555	ATA	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895866
76	NC_015555	ACA	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895866
77	NC_015555	A	6	6	3616	3621	100 %	0 %	0 %	0 %	333895866
78	NC_015555	T	6	6	3664	3669	0 %	100 %	0 %	0 %	333895866
79	NC_015555	ATT	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895866
80	NC_015555	AGA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895866
81	NC_015555	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895866
82	NC_015555	A	8	8	3726	3733	100 %	0 %	0 %	0 %	333895866
83	NC_015555	TTGAT	2	10	3761	3770	20 %	60 %	20 %	0 %	333895866
84	NC_015555	AT	3	6	3769	3774	50 %	50 %	0 %	0 %	333895866
85	NC_015555	AAT	2	6	3778	3783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895866
86	NC_015555	TGA	2	6	3798	3803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895866
87	NC_015555	GAT	2	6	3898	3903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895866
88	NC_015555	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895866
89	NC_015555	TAA	2	6	4001	4006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895866
90	NC_015555	TGA	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895866
91	NC_015555	AT	3	6	4080	4085	50 %	50 %	0 %	0 %	333895866
92	NC_015555	TAAA	2	8	4088	4095	75 %	25 %	0 %	0 %	333895866
93	NC_015555	A	8	8	4130	4137	100 %	0 %	0 %	0 %	333895866
94	NC_015555	T	6	6	4158	4163	0 %	100 %	0 %	0 %	333895866
95	NC_015555	AGG	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333895866
96	NC_015555	GTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895867
97	NC_015555	AAT	2	6	4249	4254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895867
98	NC_015555	GAA	3	9	4316	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895867
99	NC_015555	ACA	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895867
100	NC_015555	TAA	2	6	4368	4373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895867
101	NC_015555	AG	3	6	4375	4380	50 %	0 %	50 %	0 %	333895867
102	NC_015555	A	7	7	4385	4391	100 %	0 %	0 %	0 %	333895867
103	NC_015555	A	6	6	4458	4463	100 %	0 %	0 %	0 %	333895867
104	NC_015555	T	7	7	4481	4487	0 %	100 %	0 %	0 %	333895868
105	NC_015555	TTTC	2	8	4566	4573	0 %	75 %	0 %	25 %	333895868
106	NC_015555	T	7	7	4580	4586	0 %	100 %	0 %	0 %	333895868
107	NC_015555	AT	3	6	4591	4596	50 %	50 %	0 %	0 %	333895868
108	NC_015555	TCT	2	6	4680	4685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895868
109	NC_015555	ATT	2	6	4688	4693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895868
110	NC_015555	AT	3	6	4703	4708	50 %	50 %	0 %	0 %	333895868
111	NC_015555	AT	3	6	4797	4802	50 %	50 %	0 %	0 %	333895868
112	NC_015555	TAT	3	9	4808	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895868
113	NC_015555	ATC	2	6	4824	4829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895868
114	NC_015555	TCCG	2	8	4886	4893	0 %	25 %	25 %	50 %	333895868
115	NC_015555	ATT	2	6	4976	4981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895868
116	NC_015555	CT	3	6	4984	4989	0 %	50 %	0 %	50 %	333895868
117	NC_015555	ATC	2	6	5000	5005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895868
118	NC_015555	T	6	6	5014	5019	0 %	100 %	0 %	0 %	333895868
119	NC_015555	GCC	3	9	5033	5041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333895868
120	NC_015555	TCT	2	6	5129	5134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895868
121	NC_015555	TTA	2	6	5143	5148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895868
122	NC_015555	AGT	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895868
123	NC_015555	AGT	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
124	NC_015555	ATG	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
125	NC_015555	TTC	2	6	5287	5292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895869
126	NC_015555	TCT	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895869
127	NC_015555	TCT	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895869
128	NC_015555	ACA	2	6	5417	5422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895869
129	NC_015555	TAA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895869
130	NC_015555	TAT	2	6	5596	5601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895869
131	NC_015555	T	7	7	5604	5610	0 %	100 %	0 %	0 %	333895869
132	NC_015555	GTT	2	6	5656	5661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895869
133	NC_015555	TTG	2	6	5706	5711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895869
134	NC_015555	TTTAA	2	10	5789	5798	40 %	60 %	0 %	0 %	333895869
135	NC_015555	TCT	2	6	5810	5815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895869
136	NC_015555	AGT	3	9	5877	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
137	NC_015555	A	6	6	5901	5906	100 %	0 %	0 %	0 %	333895869
138	NC_015555	GTA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
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142	NC_015555	T	6	6	6115	6120	0 %	100 %	0 %	0 %	333895869
143	NC_015555	A	7	7	6163	6169	100 %	0 %	0 %	0 %	333895869
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259	NC_015555	TAG	2	6	11553	11558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895872
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261	NC_015555	A	6	6	11661	11666	100 %	0 %	0 %	0 %	333895872
262	NC_015555	TAT	2	6	11733	11738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895873
263	NC_015555	TCT	3	9	11746	11754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895873
264	NC_015555	CGT	2	6	11840	11845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895873
265	NC_015555	ACC	2	6	11925	11930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333895873
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267	NC_015555	GCA	2	6	12029	12034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895873
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